Título Abertura: Pokémon Johto [Temporada 3]
Cantor: Ricardo Afonso
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Ao regressar a Pallet, Ash e Misty reencontram Brock. Deixando Tracey como assistente do Professor Oak, o grupo segue para uma nova jornada, desta vez pela região Johto. Com uma missão do Professor Oak, Ash atira-se de cabeça à Liga Johto e defronta dois Líderes de Ginásio, enquanto adiciona novos amigos à equipa como é o caso dos três Pokémon Iniciais: Totodile, Chikorita e Cyndaquil.
Originalmente exibida na SIC (41 episódios), aos fins-de-semana, entre 12 de maio de 2001 e 29 de setembro de 2001. Com a nova divisão oficial esta temporada fica com um total de 52 episódios, recebendo os 11 episódios finais da sua antecessora.
EP119: Não Toques no ‘Dile’!
EP120: Duplos Sarilhos!
EP121: Um Final Sucolento!
EP122: Rola, Pokemon!
EP123: Confusão de Ilusão!
EP124: Poder de Flores!
EP125: O Ataque do Spinarak!
EP126: Snubbull Snobb!
EP127: O Grande Pequeno Corno!
EP128: O Salvamento da Chikorita!
EP129: Uma Vez na Lua Azul!
EP130: A Paragem do Apito!
EP131: Ignorância é Linda!
EP132: Um Roubo com Rebentos!
EP133: Lutar com Fogo contra Voadores!
EP134: Um Pokémon Barulhento!
EP135: Muito Obrigado!
EP136: As Ambições Calorosas de Charizard!
EP137: Sorria para Vencer!
EP138: A Grande Reviravolta de Chikorita!
EP139: Amigos em Tempo Falso!
EP140: O Segredo do Super Heroi!
EP141: Calmo e de Lã!
EP142: Preparados para a Batalha!
EP143: Caça ao Cyndaquil!
EP144: Uma Sombra de Seca!
EP145: Vamos Apricorn!
EP146: À Procura dos Insectos!
EP147: Um Conto Reboscado!
EP148: Truques do Ofício!
EP149: O Esquadrão de Fogo!
EP150: Nenhum Woop Grande!
EP151: Visão de Túnel!
EP152: A Hora do Houndour!
EP153: O Duelo dos Totodiles!
EP154: Combates Ardentes!
EP155: Amor ao Estilo Totodile!
EP156: Falta!
EP157: Acidente na Floresta!
EP158: Os Braços Direitos Psíquicos!
EP159: Os Caçadores da Sina!